 |
HOME CONSERVATION C-TERMINAL ANALYSES DNA AND RNA SEQUENCES RESEARCH QUESTIONS RESULTS RESOURCES REFERENCES |
|
HOME CONSERVATION C-TERMINAL ANALYSES DNA AND RNA SEQUENCES RESEARCH QUESTIONS RESULTS RESOURCES REFERENCES |
|
RLF (Rearranged L-myc fusion protein) is ZNF292’s closest paralog. It has 15 C2H2 zinc fingers which align with those of ZNF292 when a large deletion around and including ZNF292 zf9 is taken into account. There is considerable divergence in all the zinc fingers, however, making it unlikely the two have a significant overlap in DNA binding sites. The N-terminal domains of both proteins are highly similar and are likely to be involved in PPIs. ZNF292 and RLF also have similar C-terminals. Harten (2015) generated mutant mice with differences in epigenetic markers. They found RLF mutations lead to an increase in methylation at CpG island shores at many promoter sites. They hypothesized that RLF is involved in maintaining hypomethylation at specific sites. A Flag-tagged RLF construct was used in HEK293 cells to isolate RLF associated proteins. These included numerous proteins involved in transcription, chromatin modification, DNA replication and DNA repair. The strong similarities between the the N-terminals of both proteins suggests that ZNF292 may perform similar functions but at a different set of CpG islands. Location: chr 1: + 1p34.2 GRCh37.p13 40,627,041-40,706,593 GRCh38.p12 40,161,369-40,240,921 HGNC: 10025 NM_012421.3 NP_036553.2 Alterante names: ZN-15 Related, ZN-15L, ZNF292L 
|
|
RLF Domain Analysis
Estimated weight: 217.953KDa 10 20 30 40 50 MADGKGDAAA VAGAGAEAPA VAGAGDGVET ESMVRGHRPV SPAPGASGLR 60 70 80 90 100 PCLWQLETEL REQEVSEVSS LNYCRSFCQT LLQYASNKNA SEHIVYLLEV 110 120 130 140 150 YRLAIQSFAS ARPYLTTECE DVLLVLGRLV LSCFELLLSV SESELPCEVW 160 170 180 190 200 LPFLQSLQES HDALLEFGNN NLQILVHVTK EGVWKNPVLL KILSQQPVET 210 220 230 240 250 EEVNKLIAQE GPSFLQMRIK HLLKSNCIPQ ATALSKLCAE SKEISNVSSF 260 270 280 290 300 QQAYITCLCS MLPNEDAIKE IAKVDCKEVL DIICNLESEG QDNTAFVLCT 310 320 330 340 350 TYLTQQLQTA SVYCSWELTL FWSKLQRRID PSLDTFLERC RQFGVIAKTQ 360 370 380 390 400 QHLFCLIRVI QTEAQDAGLG VSILLCVRAL QLRSSEDEEM KASVCKTIAC 410 420 430 440 450 LLPEDLEVRR ACQLTEFLIE PSLDGFNMLE ELYLQPDQKF DEENAPVPNS 460 470 480 490 500 LRCELLLALK AHWPFDPEFW DWKTLKRHCH QLLGQEASDS DDDLSGYEMS 510 520 530 540 550 INDTDVLESF LSDYDEGKED KQYRRRDLTD QHKEKRDKKP IGSSERYQRW 560 570 580 590 600 LQYKFFCLLC KRECIEARIL HHSKMHMEDG IYTCPVCIKK FKRKEMFVPH 610 620 630 640 650 VMEHVKMPPS RRDRSKKKLL LKGSQKGICP KSPSAIPEQN HSLNDQAKGE 660 670 680 690 700 SHEYVTFSKL EDCHLQDRDL YPCPGTDCSR VFKQFKYLSV HLKAEHQNND 710 720 730 740 750 ENAKHYLDMK NRREKCTYCR RHFMSAFHLR EHEQVHCGPQ PYMCVSIDCY 760 770 780 790 800 ARFGSVNELL NHKQKHDDLR YKCELNGCNI VFSDLGQLYH HEAQHFRDAS 810 820 830 840 850 YTCNFLGCKK FYYSKIEYQN HLSMHNVENS NGDIKKSVKL EESATGEKQD 860 870 880 890 900 CINQPHLLNQ TDKSHLPEDL FCAESANSQI DTETAENLKE NSDSNSSDQL 910 920 930 940 950 SHSSSASMNE ELIDTLDHSE TMQDVLLSNE KVFGPSSLKE KCSSMAVCFD 960 970 980 990 1000 GTKFTCGFDG CGSTYKNARG MQKHLRKVHP YHFKPKKIKT KDLFPSLGNE 1010 1020 1030 1040 1050 HNQTTEKLDA EPKPCSDTNS DSPDEGLDHN IHIKCKREHQ GYSSESSICA 1060 1070 1080 1090 1100 SKRPCTEDTM LELLLRLKHL SLKNSITHGS FSGSLQGYPS SGAKSLQSVS 1110 1120 1130 1140 1150 SISDLNFQNQ DENMPSQYLA QLAAKPFFCE LQGCKYEFVT REALLMHYLK 1160 1170 1180 1190 1200 KHNYSKEKVL QLTMFQHRYS PFQCHICQRS FTRKTHLRIH YKNKHQIGSD 1210 1220 1230 1240 1250 RATHKLLDNE KCDHEGPCSV DRLKGDCSAE LGGDPSSNSE KPHCHPKKDE 1260 1270 1280 1290 1300 CSSETDLESS CEETESKTSD ISSPIGSHRE EQEGREGRGS RRTVAKGNLC 1310 1320 1330 1340 1350 YILNKYHKPF HCIHKTCNSS FTNLKGLIRH YRTVHQYNKE QLCLEKDKAR 1360 1370 1380 1390 1400 TKRELVKCKK IFACKYKECN KRFLCSKALA KHCSDSHNLD HIEEPKVLSE 1410 1420 1430 1440 1450 AGSAARFSCN QPQCPAVFYT FNKLKHHLME QHNIEGEIHS DYEIHCDLNG 1460 1470 1480 1490 1500 CGQIFTHRSN YSQHVYYRHK DYYDDLFRSQ KVANERLLRS EKVCQTADTQ 1510 1520 1530 1540 1550 GHEHQTTRRS FNAKSKKCGL IKEKKAPISF KTRAEALHMC VEHSEHTQYP 1560 1570 1580 1590 1600 CMVQGCLSVV KLESSIVRHY KRTHQMSSAY LEQQMENLVV CVKYGTKIKE 1610 1620 1630 1640 1650 EPPSEADPCI KKEENRSCES ERTEHSHSPG DSSAPIQNTD CCHSSERDGG 1660 1670 1680 1690 1700 QKGCIESSSV FDADTLLYRG TLKCNHSSKT TSLEQCNIVQ PPPPCKIENS 1710 1720 1730 1740 1750 IPNPNGTESG TYFTSFQLPL PRIKESETRQ HSSGQENTVK NPTHVPKENF 1760 1770 1780 1790 1800 RKHSQPRSFD LKTYKPMGFE SSFLKFIQES EEKEDDFDDW EPSEHLTLSN 1810 1820 1830 1840 1850 SSQSSNDLTG NVVANNMVND SEPEVDIPHS SSDSTIHENL TAIPPLIVAE 1860 1870 1880 1890 1900 TTTVPSLENL RVVLDKALTD CGELALKQLH YLRPVVVLER SKFSTPILDL 1910 FPTKKTDELC VGSS Zinc fingers predicted by zf.princeton.edu
CLLCKRECIEARILHHSKMH degenerate
CPVCIKKFKRKEMFVPHVMEH 16.3 584
CPGTDCSRVFKQFKYLSVHLKAEH 22.9 672
CTYCRRHFMSAFHLREHEQVH 11.0 716
CVSIDCYARFGSVNELLNHKQKH 10.8 744
CELNGCNIVFSDLGQLYHHEAQH 22.4 773
CNFLGCKKFYYSKIEYQNHLSMH 20.6 803
CGFDGCGSTYKNARGMQKHLRKVH 23.0 956
CELQGCKYEFVTREALLMHYLKKH 18.5 1129
CHICQRSFTRKTHLRIHYKNKH 28.0 1174
CIHKTCNSSFTNLKGLIRHYRTVH 14.7 1312
CKYKECNKRFLCSKALAKHCSDSH 8.3 1364
CNQPQCPAVFYTFNKLKHHLMEQH 13.6 1409
CDLNGCGQIFTHRSNYSQHVYYRH 17.2 1446
CMVQGCLSVVKLESSIVRHYKRTH 8.1 1551
SMART Predictions (high confidence)
feature start end E-value low complexity 2 28 low complexity 129 149 low complexity 298 309 ZnF_C2H2 555 576 127 ZnF_C2H2 582 604 0.0944 low complexity 616 622 ZnF_C2H2 671 696 0.0542 ZnF_C2H2 714 736 0.809 ZnF_C2H2 742 766 3.99 ZnF_C2H2 771 795 0.00316 ZnF_C2H2 801 825 0.0156 low complexity 892 907 ZnF_C2H2 954 979 0.00257 low complexity 1061 1072 ZnF_C2H2 1127 1152 0.0059 ZnF_C2H2 1172 1195 0.00363 low complexity 1258 1269 low complexity 1276 1292 ZnF_C2H2 1310 1335 0.0506 ZnF_C2H2 1362 1387 4.57 ZnF_C2H2 1407 1432 0.0334 ZnF_C2H2 1444 1469 0.0881 ZnF_C2H2 1549 1574 4.81 RLF to ZNF292 Alignment 
ZNF292 to RLF Alignment in MVIEW format Consensus key: ■=100% ■=90% ■=80% ■=70% ■=<%70 blank=no match -=insert LCR cons ■■■■■■----------------------■■■■■■■■■■■■■--■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 MADEEA----------------------EQERLSCGEGGCV--AELQRLGERLQELELQL 36 MAD :. E E : G. . L L :LE :L MADtcu......................EpEphspGctsss..sthptLt.pL.pLEhpL RLF MADGKGDAAAVAGAGAEAPAVAGAGDGVETESMVRGHRPVSPAPGASGLRPCLWQLETEL 60 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ LCR cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 RESRVPAVEAATDYCQQLCQTLLEYAEKWKTSEDPLPLLEVYTVAIQSYVKARPYLTSEC 96 RE..V V :: :YC:.:FCQYL:YA.: ::SE. : LLEVY :AIQS:..ARPYLT:EC REpcVstV.uuhsYCpphCQTLLpYApphpsSEc.l.LLEVYplAIQSaspARPYLToEC RLF REQEVSEV-SSLNYCRSFCQTLLQYASNKNASEHIVYLLEVYRLAIQSFASARPYLTTEC 119 cons ■■■■■■■■-■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ LCR cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■-■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 ENVALVLERLALSCVELLLCLP-VELSDKQWEQFQTLVQVAHEKLMENGSCELHFLATLA 155 E:V LVL RL.LSC.ELLL.: EL : W F :Q :H: L:E G. :L::L. : EsVhLVLtRLsLSChELLLsls.sELssc.W..F.p.lQ.uH-tLhE.GsspLphLspl. RLF EDVLLVLGRLVLSCFELLLSVSESELPCEVWLPFLQSLQESHDALLEFGNNNLQILVHV- 178 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■- LCR cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 QETGVWKNPVLCTILSQEPLDKDKVNEFLAFEGPILLDMRIKHLIKTNQLSQATALAKLC 215 : GVWKNPVL .ILSQ:P::.::VN:::A EGP :L:MRIKHL:K:N : QATAL:KLC pcpGVWKNPVLhpILSQpPl-p-cVNchlA.EGP.hLpMRIKHLlKoNplsQATALuKLC RLF TKEGVWKNPVLLKILSQQPVETEEVNKLIAQEGPSFLQMRIKHLLKSNCIPQATALSKLC 238 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 SDHPEIGIKGSFKQTYLVCLCTSSPNGKLIEEISEVDCKDALEMICNLESEGDEKSALVL 275 :: EI. .SF:Q:Y:.CLC: PN . I:EI::VFCK:.L::ICNLESEG::::A:VL u-p.EIu.huSFpQsYlsCLCo..PNtchIcEIucVDCK-sL-hICNLESEGp-poAhVL RLF AESKEISNVSSFQQAYITCLCSMLPNEDAIKEIAKVDCKEVLDIICNLESEGQDNTAFVL 298 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ LCR cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 CTAFLSRQLQQGDMYCAWELTLFWSKLQQRVEPSIQVYLERCRQLSLLTKTVYHIFFLIK 335 CT::L::QLQ ..:YC:WELTLFWSKLQ:R::PS::.:LERCRQ:.:::KT H:F LI: CTsaLopQLQpushYCuWELTLFWSKLQpRl-PSlpsaLERCRQhullsKT..HlFhLI+ RLF CTTYLTQQLQTASVYCSWELTLFWSKLQRRIDPSLDTFLERCRQFGVIAKTQQHLFCLIR 358 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ LCR cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 VINSETEGAGLATCIELCVKALRLESTENTEVKISICKTISCLLPDDLEVKRACQLSEFL 395 VI::E::.AGL...I LCV:AL:L.S:E: E:K S:CKTI:CLLP:DDLE:RACQL:EFL VIpoEspsAGLussI.LCV+ALpLcSoEspEhKhSlCKTIuCLLP-DLEV+RACQLoEFL RLF VIQTEAQDAGLGVSILLCVRALQLRSSEDEEMKASVCKTIACLLPEDLEVRRACQLTEFL 418 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 IEPTVDAYYAVEMLYNQPDQKYDEENLPIPNSLRCELLLVLKTQWPFDPEFWDWKTLKRQ 455 IEP::D.: :E LY QPDQK:DEEN P:PNSLRCELLL.LK::WPFDPEFWDWKTLKR: IEPolDua.hlE.LY.QPDQKaDEENhPlPNSLRCELLLsLKspWPFDPEFWDWKTLKRp RLF IEPSLDGFNMLEELYLQPDQKFDEENAPVPNSLRCELLLALKAHWPFDPEFWDWKTLKRH 478 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ cons ■■■■■■■■■■■■■■■-----■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 CLALMGEEASIVSSI-----DELNDSEVYEKVVDYQEESKETSMNGLSGGVGANSGLLKD 510 C L:G:EAS .. .:ND::V E..:. . G :. :D ChtLhGpEAS.sss.......plNDo-VhEphls.............stGhtspphhh+D RLF CHQLLGQEASDSDDDLSGYEMSINDTDVLESFLSDY-----------DEGKEDKQYRRRD 527 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■-----------■■■■■■■■■■■■■ ZF1 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 IGDEKQKKREIKQLRERGFISARFRNWQAYMQYCVLCDKEFLGHRIVRHAQKHYKDGIYS 570 : D::::KR: K S R::.W Y :C:LC.:E : RI::H:: H :DGIY: lsDp+pcKR-hK.....hh.StRappW.tYh.aClLCc+EhlttRIl+HuphHhcDGIYo RLF LTDQHKEKRDKKP----IGSSERYQRWLQYKFFCLLCKRECIEARILHHSKMHMEDGIYT 583 cons ■■■■■■■■■■■■■----■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZF1 ZF2 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 CPICAKNFNSKETFVPHVTLHVKQSSKERLAAMKPLRRLGRPPKITTTNENQKTNTVAKQ 630 CP:C K:F: KE FVPHV HVK ..R : K L G I .. . :: :Q CPlChKpFppKEhFVPHVh.HVK.sspcR.tuhK.LhhhGp..tIssps.s....slscQ RLF CPVCIKKFKRKEMFVPHVMEHVKMPPSRRDRSKKKLLLKGSQKGICPKSPS----AIPEQ 639 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■----■■■■■ ZF2 LCR LCR ZF3 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 EQRPIKKNSLYSTDFIVFNDNDGSDDENDDKDKSYEPEVIPVQKPVPVNEFNCPVTFCKK 690 :: .: . S :::.F.. : : : : CP T C.: ppp..cpsph.Sp-alsFsc.-...................sp+..shs.asCPsT.Cp+ RLF NHSLNDQAKGESHEYVTFSKLE-------------------DCHLQDRDLYPCPGTDCSR 680 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■-------------------■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZF3 ZF4 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■--■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 GFKYFKNLIAHVKGHK--DNEDAKRFLEMQSKKVICQYCRRHFVSVTHLNDHLQMHCGSK 748 FK FK L .H:K..: ::E:AK::L:M:.:: C YCRRHF:S. HL.:H Q:HCG : sFK.FK.L.sHlKuc+..ssEsAK+aL-Mps++.hCpYCRRHFhSshHLp-H.QhHCGsp RLF VFKQFKYLSVHLKAEHQNNDENAKHYLDMKNRREKCTYCRRHFMSAFHLREHEQVHCGPQ 740 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZF4 ZF5 ZF6 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■--■ ZNF292 PYICIQMKCKAGFNSYAELLTHRKEHQVFRAKCMFPKCGRIFSEAYLLYDHEAQHYN--T 806 PY:C:.:.C A F.S ELL.H:::H: :R KC : C. :FS: LY.HEAQH:. : PYhClphcChAtFsShsELLsH+pcHpshRhKC.hstCshlFS-hh.LYcHEAQHap..o RLF PYMCVSIDCYARFGSVNELLNHKQKHDDLRYKCELNGCNIVFSDLGQLYHHEAQHFRDAS 800 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZF5 ZF6 ZF7 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 YTCKFTGCGKVYRSQGELEKHLDDHSTPPEKVLPPEAQLNSSGDSIQPSEVNQNTAENIE 866 YTC:F GC K.Y S: E ::HL. H.. . .GD : :: YTCpFhGCtKhYhSphEhppHLs.Hss.sp...........sGD.hpsscl......... RLF YTCNFLGCKKFYYSKIEYQNHLSMHNVENS-----------NGDIKKSVKL--------- 840 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■-----------■■■■■■■■■■--------- ZF7 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 KERSMLPSENNIENSLLADRSDAWDKSKAESAVTKQDQISASELRQANGPLSNGLENPAT 926 E:S . ............EpShhu.......................................... RLF ------------EESATG------------------------------------------ 846 cons ------------■■■■■■------------------------------------------ cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 TPLLQSSEVAVSIKVSLNQGIEDNFGKQENSTVEGSGEALVTDLHTPVEDTCNDLCHPGF 986 ............................................................ RLF ------------------------------------------------------------ 846 cons ------------------------------------------------------------ cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■----------■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■--■■■■■■■ ZNF292 QERKEQDCFNDAHVTQNSLVN----------SETLKIGDLTPQNLERQVNN--LMTFSVQ 1034 ::QDC:N: H: ::: . S . :I. T :NL:.: :. :S . ...ccQDChNpsHlhppo.hs..........Sts.pIss.TspNLccpsss....phShp RLF ---EKQDCINQPHLLNQTDKSHLPEDLFCAESANSQIDTETAENLKENSDSNSSDQLSHS 903 cons ---■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 NQAAFQNNLPTSKFECGDNVKTSSNLYNLPLKTLESIAFVPPQSDLSNSLGTPSVPPKAP 1094 ..A:::::L D.:. S..: :: L.. . .F P .L.: S: spAuhpppL.......hDslcpSpsh.sl.Lps..phsFsPs..sLpp..tssShssphs RLF SSASMNEEL-------IDTLDHSETMQDVLLSN--EKVFGPS--SLKE--KCSSMAVCFD 950 cons ■■■■■■■■■-------■■■■■■■■■■■■■■■■■--■■■■■■■--■■■■--■■■■■■■■■■ ZF8 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 VQKFSCQVEGCTRTYNSSQSIGKHMKTAHPDQYAAFKMQRKSKKGQKANNLNTPNNGKFV 1154 KF:C .:GC TY:.::.: KH::..HP :: K:: K. spKFoCth-GCspTYpsupuhtKHh+psHP.patshKhppKs.................. RLF GTKFTCGFDGCGSTYKNARGMQKHLRKVHPYHFKPKKIKTKD------------------ 992 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■------------------ ZF8 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 YFLPSPVNSSNPFFTSQTKANGNPACSAQLQHVSPPIFPAHLASVSTPLLSSMESVINPN 1214 ............................................................ RLF ------------------------------------------------------------ 992 cons ------------------------------------------------------------ cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 ITSQDKNEQGGMLCSQMENLPSTALPAQMEDLTKTVLPLNIDSGSDPFLPLPAESSSMSL 1274 L ...........................................................L RLF -----------------------------------------------------------L 993 cons -----------------------------------------------------------■ cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 FPSPADSGTNSVFSQLENNTNHYSSQIEGNTNSSFLKGGNGENAVFPSQVNVANNFSSTN 1334 FPS N: N: :.:: FPS.............tNppNphoppl................................. RLF FPSL------------GNEHNQTTEKL--------------------------------- 1008 cons ■■■■------------■■■■■■■■■■■--------------------------------- ZF9 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 AQQSAPEKVKKDRGRGPNGKERKPKHNKRAKWPAIIRDGKFICSRCYRAFTNPRSLGGHL 1394 ............................................................ RLF ------------------------------------------------------------ 1008 cons ------------------------------------------------------------ cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 SKRSYCKPLDGAEIAQELLQSNGQPSLLASMILSTNAVNLQQPQQSTFNPEACFKDPSFL 1454 :P: C . ..............................................shpPcsC.c..... RLF ----------------------------------------------DAEPKPCSD----- 1017 cons ----------------------------------------------■■■■■■■■■----- cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 QLLAENRSPAFLPNTFPRSGVTNFNTSVSQEGSEIIKQALETAGIPSTFEGAEMLSHVST 1514 ............................................................ RLF ------------------------------------------------------------ 1017 cons ------------------------------------------------------------ cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 GCVSDASQVNATVMPNPTVPPLLHTVCHPNTLLTNQNRTSNSKTSSIEECSSLPVFPTND 1574 S P: : :H C: : Q. ....ssS.....s.Ps.sls..lHhhC+.pp....Qs....................... RLF ----TNS-----DSPDEGLDHNIHIKCKREH----QG----------------------- 1041 cons ----■■■-----■■■■■■■■■■■■■■■■■■■----■■----------------------- cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 LLLKTVENGLCSSSFPNSGGPSQNFTSNSSRVSVISGPQNTRSSHLNKKGNSASKRRKKV 1634 : E..:C:S. P ...hosEsulCuSphP............................................ RLF ---YSSESSICASKRP-------------------------------------------- 1054 cons ---■■■■■■■■■■■■■-------------------------------------------- cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 APPLIAPNASQNLVTSDLTTMGLIAKSVEIPTTNLHSNVIPTCEPQSLVENLTQKLNNVN 1694 C ::::E L : ..........................................Cp.pohlE.Lh.+..... RLF ------------------------------------------CTEDTMLELLL-R----- 1066 cons ------------------------------------------■■■■■■■■■■■-■----- LCR cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 NQLFMTDVKENFKTSLESHTVLAPLTLKTENGDSQMMALNSCTTSINSDLQISEDNVIQN 1754 L L:LK.. I : . .....................Lt.LoLKsp...............I......o....hts RLF ---------------------LKHLSLKNS---------------I------T----HGS 1080 cons ---------------------■■■■■■■■■---------------■------■----■■■ cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 FEKTLEIIKTAMNSQILEVKSGSQGAGETSQNAQINYNIQLPSVNTVQNNKLPDSSPFSS 1814 F. :L .G .:G .S L SV FptoL...............pG..uuGtpS..........L.SV................ RLF FSGSL---------------QGYPSSGAKS----------LQSV---------------- 1099 cons ■■■■■---------------■■■■■■■■■■----------■■■■---------------- cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 FISVMPTKSNIPQSEVSHKEDQIQEILEGLQKLKLENDLSTPASQCVLINTSVTLTPTPV 1874 ............................................................ RLF ------------------------------------------------------------ 1099 cons ------------------------------------------------------------ ZF10 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 KSTADITVIQPVSEMINIQFNDKVNKPFVCQNQGCNYSAMTKDALFKHYGKIHQYTPEMI 1934 .S :D:.. : .:M . : : . KPF.C: QGC:Y. :T::AL: HY K H:Y: E : pShuDlsh.p.sppM.s..hsphssKPFhCp.QGCpYphhT+-ALhhHYhKhHpYo.Ehl RLF SSISDLNFQNQDENMPSQYLAQLAAKPFFCELQGCKYEFVTREALLMHYLKKHNYSKEKV 1159 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZF10 ZF11 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 LEIKKNQLKFAPFKCVVPTCTKTFTRNSNLRAHCQLVHHFTTEEMVKLKIKRPYGRKSQS 1994 L::. Q :::PF:C : C ::FTR:::LR H : H:: ::. .: :.. . Lplph.Qh+auPFpChl..Cp+oFTRpopLRhHhp.hHphso-chs+hhlcp.hs....s RLF LQLTMFQHRYSPFQCHI--CQRSFTRKTHLRIHYKNKHQIGSDRATHKLLDNEKC----D 1213 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■--■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■----■ ZF11 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 ENVPASRSTQVKKQLAMTEENKKESQPALELRAETQNTHSNVAVIPEKQLVEKKSPDKTE 2054 .: P.S ::K : : EL .: ... .: P:K: .:E cpsPsSh.splKt............psuhELtu-spsspppstshPcKp.s......poE RLF HEGPCSV-DRLKG------------DCSAELGGDPSSNSEKPHCHPKKDEC------SSE 1254 cons ■■■■■■■-■■■■■------------■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■------■■■ LCR cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■---■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 SSLQVITVTSEQCNTNALTNTQTKGRKIRRHKKEKEE---KKRKKPVSQSLEFPTRYSPY 2111 :.L ...C: . :T. . I H::E:E : :: V::. . : osL......pppCppst..pTpshup.ItpH+cEpEt...+tp++sVupu..h.hh.p.a RLF TDL------ESSCEETES-KTSDISSPIGSHREEQEGREGRGSRRTVAKGNLCYILNKYH 1307 cons ■■■------■■■■■■■■■-■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ LCR LCR ZF12 LCR cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 RPYRCVHQGCFAAFTIQQNLILHYQAVHKSDLPAFSAEVEEESEAGKESEETETKQTLKE 2171 :P::C:H: C ::FT :.LI HY::VH: : :. E :: : E : K +Pa+ClHpsC.uuFT..psLIhHYpsVHp.sh.thshEh-c......tppcpEhhpshK. RLF KPFHCIHKTCNSSFTNLKGLIRHYRTVHQYNKEQLCLEKDK------ARTKRELVKCKKI 1361 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■------■■■■■■■■■■■■■ ZF12 ZF13 ZF14 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■-■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 FRCQVSDCSRIFQAITGLIQHYMKLHEMTPE-EIESMTASVDVGKFPCDQLECKSSFTTY 2230 F C: .:C.: F . ..L :H . H:: E : :: : ...:F C:Q :C : F T: FtCphp-Cs+hF.s.puLhpHh.c.Hphs...E.cshotusssu+FsCsQ.pC.usFhTa RLF FACKYKECNKRFLCSKALAKHCSDSHNLDHIEEPKVLSEAGSAARFSCNQPQCPAVFYTF 1421 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZF13 ZF14 ZF15 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 LNYVVHLEADHGIGLRASKTEEDGVYKCDCEGCDRIYATRSNLLRHIFNKHNDKHKAHLI 2290 : HL :H.I . ..D :CD :GC.:I:: RSN :H:: :H:D :. : .phhhHL.tpHsIthc...hcpDh.h+CDhpGCspIaspRSNh.pHla.+HpDhacshh. RLF NKLKHHLMEQHNIEGE---IHSDYEIHCDLNGCGQIFTHRSNYSQHVYYRHKDYYDDLF- 1477 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■---■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■- ZF15 LCR cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 RPRRLTPGQENMSSKANQEKSKSKHRGTKHSRCGKEGIKMPKTKRKKKNNLENKNAKIVQ 2350 R :::: : S.K. Q . :G :H. .T:R .:: K. K Rsp+lsstp..hSpKssQpt...cppGpcHp..........pT+R....shpsKstK... RLF RSQKVANERLLRSEKVCQTA---DTQGHEHQ----------TTRR----SFNAKSKK--- 1517 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■---■■■■■■■■----------■■■■----■■■■■■■■--- ZF16 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■-■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 IEENKPYSLKRGKHVYSIKARNDALSECTS-RFVTQYPCMIKGCTSVVTSESNIIRHYKC 2409 :K. K S:K:R :AL C.. TQYPCM::GC SVV. ES.I:RHYK .....sh.lKctKtshShKsRs-ALp.Csp.p.hTQYPCMlpGChSVVp.ESsIlRHYKp RLF -----CGLIKEKKAPISFKTRAEALHMCVEHSEHTQYPCMVQGCLSVVKLESSIVRHYKR 1572 cons -----■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZF16 cons ■-■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■-■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 H-KLSKAFTSQHRNLLIVFKRCCNSQVKETSEQEG-AKNDVKDSDTCVSESNDNSRTTAT 2467 ::S.S: .Q: : L:V : :::KE .E. . ::. :C SE .::S:: . p.phSpAahpQphp.LlVhh+hs.oplKEps.pEu.sp.chc-scoC.SEps-pS+osus RLF THQMSSAYLEQQMENLVVCVKYG-TKIKEEPPSEADPCIKKEENRSCESERTEHSHSPGD 1631 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■-■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ cons ----■■■------■■■■■■■■■■------■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 ----VSQ------KEVEKNEKDE------MDELTELFITKLINEDSTSVETQANTSSNVS 2511 :.: .E : .:K. :D T L: .L :.S: .TS : . ....lpp......pEh-tspKsp......hDt.T.LahspLhspcSo.h....sTS.p.s RLF SSAPIQNTDCCHSSERDGGQKGCIESSSVFDADTLLYRGTLKCNHSS-K----TTSLEQC 1686 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■-■----■■■■■■■ cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■-----■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 NDFQEDNLCQSERQKASNLKRVNKE-----KNVSQNKKRKVEKAEPASAAELSSVRKEEE 2566 N .Q C: E.. . : .:. :: : :: E. . S:.: .:V:: . N.hQ.ss.Cp.Epphsss.ptsppt.....hpls.s+h+csEp.c.tSuup.soV+p.pc RLF NIVQPPPPCKIENSIPNP-NGTESGTYFTSFQLPLPRIKESET-RQHSSGQENTVKNPTH 1744 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■-■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■-■■■■■■■■■■■■■■■■ cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■---■■■■■■ ZNF292 TAVAIQTIEEHPASFDWSSFKPMGFEVSFLKFLEESAVKQKKNTDKDHPNT---GNKKGS 2623 . ..:P SFD .::KPMGFE SFLKF::ES K:.. D : : .N.. S ssht..phcppPtSFDhpoaKPMGFEsSFLKFlpESt.Kpcc.sDh-.spp...uNpptS RLF VPKENFRKHSQPRSFDLKTYKPMGFESSFLKFIQESEEKEDDFDDWEPSEHLTLSNSSQS 1804 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ cons ■■■■-------------■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 HSNS-------------RKNIDKTAVTSGNHVCPCKESETFVQFANPSQLQCSDNVKIVL 2670 .: . ::D :S.. : : : .A: : : . :N:::VL pss..............c.plDhstsoSssplp.shpu.s.l.hApsopl.s.-Nl+lVL RLF SNDLTGNVVANNMVNDSEPEVDIPHSSSDSTIHENLTAIPPLIVAETTTVPSLENLRVVL 1864 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■---■■■■■■■■■■■■■■ ZNF292 DKNLKDCTELVLKQLQEMKPTVSLKKLEVHSNDPDMSVM---KDISIGKATGRGQY 2723 DK L.DC EL.LKQL: ::P.V L:: :. : D: .::.:G.: DKsLpDCsELsLKQLp.h+PsVsLc+.chpos..Dh.sh...c-lslGpu...... RLF DKALTDCGELALKQLHYLRPVVVLERSKFSTPILDLFPTKKTDELCVGSS------ 1914 cons ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■------ RLF Raw Sequence >RLF Zinc finger protein Rlf OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RLF PE=1 SV=2 MADGKGDAAAVAGAGAEAPAVAGAGDGVETESMVRGHRPVSPAPGASGLRPCLWQLETEL REQEVSEVSSLNYCRSFCQTLLQYASNKNASEHIVYLLEVYRLAIQSFASARPYLTTECE DVLLVLGRLVLSCFELLLSVSESELPCEVWLPFLQSLQESHDALLEFGNNNLQILVHVTK EGVWKNPVLLKILSQQPVETEEVNKLIAQEGPSFLQMRIKHLLKSNCIPQATALSKLCAE SKEISNVSSFQQAYITCLCSMLPNEDAIKEIAKVDCKEVLDIICNLESEGQDNTAFVLCT TYLTQQLQTASVYCSWELTLFWSKLQRRIDPSLDTFLERCRQFGVIAKTQQHLFCLIRVI QTEAQDAGLGVSILLCVRALQLRSSEDEEMKASVCKTIACLLPEDLEVRRACQLTEFLIE PSLDGFNMLEELYLQPDQKFDEENAPVPNSLRCELLLALKAHWPFDPEFWDWKTLKRHCH QLLGQEASDSDDDLSGYEMSINDTDVLESFLSDYDEGKEDKQYRRRDLTDQHKEKRDKKP IGSSERYQRWLQYKFFCLLCKRECIEARILHHSKMHMEDGIYTCPVCIKKFKRKEMFVPH VMEHVKMPPSRRDRSKKKLLLKGSQKGICPKSPSAIPEQNHSLNDQAKGESHEYVTFSKL EDCHLQDRDLYPCPGTDCSRVFKQFKYLSVHLKAEHQNNDENAKHYLDMKNRREKCTYCR RHFMSAFHLREHEQVHCGPQPYMCVSIDCYARFGSVNELLNHKQKHDDLRYKCELNGCNI VFSDLGQLYHHEAQHFRDASYTCNFLGCKKFYYSKIEYQNHLSMHNVENSNGDIKKSVKL EESATGEKQDCINQPHLLNQTDKSHLPEDLFCAESANSQIDTETAENLKENSDSNSSDQL SHSSSASMNEELIDTLDHSETMQDVLLSNEKVFGPSSLKEKCSSMAVCFDGTKFTCGFDG CGSTYKNARGMQKHLRKVHPYHFKPKKIKTKDLFPSLGNEHNQTTEKLDAEPKPCSDTNS DSPDEGLDHNIHIKCKREHQGYSSESSICASKRPCTEDTMLELLLRLKHLSLKNSITHGS FSGSLQGYPSSGAKSLQSVSSISDLNFQNQDENMPSQYLAQLAAKPFFCELQGCKYEFVT REALLMHYLKKHNYSKEKVLQLTMFQHRYSPFQCHICQRSFTRKTHLRIHYKNKHQIGSD RATHKLLDNEKCDHEGPCSVDRLKGDCSAELGGDPSSNSEKPHCHPKKDECSSETDLESS CEETESKTSDISSPIGSHREEQEGREGRGSRRTVAKGNLCYILNKYHKPFHCIHKTCNSS FTNLKGLIRHYRTVHQYNKEQLCLEKDKARTKRELVKCKKIFACKYKECNKRFLCSKALA KHCSDSHNLDHIEEPKVLSEAGSAARFSCNQPQCPAVFYTFNKLKHHLMEQHNIEGEIHS DYEIHCDLNGCGQIFTHRSNYSQHVYYRHKDYYDDLFRSQKVANERLLRSEKVCQTADTQ GHEHQTTRRSFNAKSKKCGLIKEKKAPISFKTRAEALHMCVEHSEHTQYPCMVQGCLSVV KLESSIVRHYKRTHQMSSAYLEQQMENLVVCVKYGTKIKEEPPSEADPCIKKEENRSCES ERTEHSHSPGDSSAPIQNTDCCHSSERDGGQKGCIESSSVFDADTLLYRGTLKCNHSSKT TSLEQCNIVQPPPPCKIENSIPNPNGTESGTYFTSFQLPLPRIKESETRQHSSGQENTVK NPTHVPKENFRKHSQPRSFDLKTYKPMGFESSFLKFIQESEEKEDDFDDWEPSEHLTLSN SSQSSNDLTGNVVANNMVNDSEPEVDIPHSSSDSTIHENLTAIPPLIVAETTTVPSLENL RVVLDKALTDCGELALKQLHYLRPVVVLERSKFSTPILDLFPTKKTDELCVGSS |